正确答案 ：D

解析

【答案】D
【解析】本题考查词法——动词词组辨析。
句意：他昨天早上办理了入住手续，将会停留3天。
D项：check in：（在旅馆、机场等）登记，报到。符合题意，故选D。
A项：check up：检查，核实。不符合题意，故排除。
B项：check on：核实，检查。不符合题意，故排除。
C项：check out：检验，结账离开。不符合题意，故排除。
故本题答案为D。